O Programa de Pós-Graduação em Engenharia Hidráulica e Saneamento desenvolve pesquisas com enfoque multidisciplinar e interdisciplinar sobre qualidade e quantidade dos recursos hidricos, disposição e tratamento de resíduos sólidos e controle da poluição atmosférica. Desde 2003, o programa vem recebendo nota máxima da CAPES (7).